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輝駿生物為您提供權(quán)威的RNA pulldown實(shí)驗(yàn)指南與解決方案。本文詳細(xì)闡述RNA Pull-Down實(shí)驗(yàn)原理、詳細(xì)操作流程、關(guān)鍵問題排查及結(jié)果分析。輝駿自主研發(fā)的F2標(biāo)記RNA探針專利技術(shù),有效規(guī)避傳統(tǒng)生物素標(biāo)記的弊端,顯著提升實(shí)驗(yàn)效率與成功率。同時(shí),我們提供多種Pull-Down試劑盒、專業(yè)的WB驗(yàn)證與質(zhì)譜鑒定服務(wù),是您研究RNA-蛋白質(zhì)相互作用的可靠伙伴
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磁珠是一種具有超順磁性的微小球體,由磁性內(nèi)核(通常為鐵的衍生物)、生物相容性外殼以及表面偶聯(lián)的各種功能配體組成。這種獨(dú)特結(jié)構(gòu)使磁珠在外加磁場作用下表現(xiàn)出弱磁性,便于快速吸附分離,而撤去磁場后自身就不再帶有磁性,可輕松重懸分散。輝駿生物納米抗體磁珠試用于免疫沉淀 (IP):免疫共沉淀(CoIP)、RNA結(jié)合蛋白免疫共沉淀(RIP)、染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP),價(jià)格低,高效完成各類實(shí)驗(yàn)
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His標(biāo)簽“性價(jià)比之王”,適合多數(shù)常規(guī)場景,如常見的His pull down;GST標(biāo)簽“提高可溶性”,最適合蛋白相互作用分析,如GST pull down;Strep-Tag II 標(biāo)簽“高純度、敏感蛋白首選”,適合嚴(yán)苛實(shí)驗(yàn)需求;MBP標(biāo)簽“難溶蛋白的救星.輝駿生物提供各種類型蛋白互作試劑盒以及互作實(shí)驗(yàn)服務(wù)(RIP、RNA pull down、ChIP、DNA pull down、IP實(shí)驗(yàn)),可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求定進(jìn)行選擇,助力您的科研更高效、更精準(zhǔn)!
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當(dāng)誘餌蛋白IP抗體不好用或者內(nèi)源表達(dá)量低時(shí),可以在樣本中融合表達(dá)帶有特定標(biāo)簽的誘餌蛋白(Bait),利用標(biāo)簽抗體做免疫沉淀。輝駿生物ChainFree?納米抗體磁珠、coip試劑盒等產(chǎn)品助力 眾多客戶高效完成Co-IP實(shí)驗(yàn),并在知名期刊發(fā)表IF>10的高分文獻(xiàn)!
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在 COIP 實(shí)驗(yàn)中,磁珠結(jié)塊是一個(gè)令科研人員頗為頭疼的問題,不僅會(huì)影響蛋白結(jié)合效率,導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)性差,還可能使大量時(shí)間和精力付諸東流。輝駿生物ChainFree? 納米抗體磁珠在 COIP 實(shí)驗(yàn)中表現(xiàn)卓越,磁珠粒徑均勻,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的均一性與穩(wěn)定性,能夠精準(zhǔn)地富集目標(biāo)蛋白 - 蛋白復(fù)合物,減少非特異性結(jié)合,讓W(xué)B條帶更清晰。同時(shí),在蛋白質(zhì)純化領(lǐng)域,可高效分離出高純度的目標(biāo)蛋白,滿足科研及生物制藥等多方面需求。
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IP(免疫沉淀),是指利用抗體來沉淀目標(biāo)蛋白,并同時(shí)沉淀它的結(jié)合伙伴(可以是蛋白、DNA片段或者RNA),以確定它們之間的相互作用關(guān)系。
Co-IP、RIP、ChIP三種實(shí)驗(yàn)在操作流程上有所不同,但原理和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)是一致的。輝駿生物以沉淀結(jié)合蛋白為例,講解IP實(shí)驗(yàn)的組別設(shè)計(jì),并標(biāo)注了IP結(jié)果的各個(gè)條帶所代表的含義。
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輝駿生物的ChainFree?標(biāo)簽納米抗體磁珠(Flag、HA、V5、GFP、mCherry),除了徹底解決輕重鏈污染問題,經(jīng)序列改造的 ChainFree? 納米抗體對(duì)靶蛋白親和力提升 3-5 倍,具有更高的親和力,單次實(shí)驗(yàn)僅需 5μl-20μl 即可實(shí)現(xiàn)高效免疫沉淀。小劑量高回報(bào):減少抗體用量的同時(shí),降低非特異性結(jié)合,實(shí)驗(yàn)成本直降 50%!
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蛋白質(zhì)間相互作用是其發(fā)揮功能的主要模式,蛋白質(zhì)通過結(jié)合不同的伙伴來行駛不同功能,形成復(fù)雜的信號(hào)網(wǎng)絡(luò)。免疫共沉淀(Co-IP)、pull down、熒光共定位等都是最常見的蛋白互作研究方法。輝駿生物的合作伙伴——中山大學(xué)腫瘤中心華南腫瘤學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在Cancer Research(1區(qū),IF=12.5)上發(fā)表的論文,就同時(shí)采用了Co-IP和GST pull down方法,研究了糖原合成酶2(GYS2)在乙肝病毒相關(guān)性肝癌中的機(jī)制。
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RNA pulldown探針制備先確定目標(biāo)序列,根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康拇_定合適的RNA序列,可以是目標(biāo)轉(zhuǎn)錄本的全部序列或部分序列,對(duì)照組通常采用反義序列,也可以是無關(guān)序列.如果目標(biāo)序列小于100bp,建議直接合成帶標(biāo)記的RNA,如果大于100bp,可按照輝駿生物提供的步驟體外轉(zhuǎn)錄獲得.為解決RNA探針標(biāo)記的難題,輝駿生物研發(fā)了一種新的標(biāo)記方法,利用一段只有16nt的RNA標(biāo)簽“F2”來標(biāo)記RNA,100%標(biāo)記,操作簡單,成本低
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RNA pulldown用于檢測RNA-蛋白質(zhì)、或RNA-RNA之間相互作用的技術(shù),其基本原理是:利用帶標(biāo)簽的目標(biāo)RNA探針與待測蛋白質(zhì)或RNA進(jìn)行體外或體內(nèi)結(jié)合,通過親和作用將復(fù)合物分離出來,之后采用Western Blot、質(zhì)譜技術(shù)檢測結(jié)合蛋白或采用qPCR、測序技術(shù)檢測結(jié)合RNA。輝駿生物研發(fā)了一種新的標(biāo)記方法,利用一段只有16nt的RNA標(biāo)簽“F2”來標(biāo)記RNA,再采用與F2具有強(qiáng)大親和力的配體磁珠捕獲互作復(fù)合體。這種標(biāo)記方法可用于標(biāo)記各種類型的RNA(lnRNA、mRNA、circRNA、pre-miRNA或pri-miRNA),操作簡單、成本低。
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難道沒有完全無污染的抗體beads嗎?當(dāng)然有!結(jié)合多年的互作實(shí)驗(yàn)和質(zhì)譜經(jīng)驗(yàn),輝駿生物開發(fā)了專門解決輕重鏈污染問題的ChainFree?納米抗體磁珠,涵蓋了目前主流的多種標(biāo)簽,比如Flag、HA、Myc、V5、GFP、RFP。該磁珠上偶聯(lián)了經(jīng)過嚴(yán)格篩選、優(yōu)化并重組表達(dá)的無輕、重鏈的標(biāo)簽抗體,完全解決了抗體污染問題
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輝駿生物可提供rip、rip seq、rip qpcrS實(shí)驗(yàn),價(jià)格低 周期短,可對(duì)圍繞RNA結(jié)合蛋白開展的整體課題提供全方位方案建議.RIP/RIP-seq或RNA免疫沉淀/RNA免疫沉淀測序是一種高通量實(shí)驗(yàn)技術(shù),用于研究RNA和RNA結(jié)合蛋白之間的相互作用。它允許識(shí)別細(xì)胞或組織內(nèi)的特定RNA結(jié)合蛋白。